Я же написал: извлечать звук из фильма, отредактировать в любом звуковом редакторе, вставить этот отредактированный звук в фильм, посмотреть, синхронно ли, определить на слух, где и насколько расходится, снова подправить в звуковом редакторе и т.д., пока не достигните нужного результата. И так для каждой части.

Также почитайте тему "Синхронизация звука и изображения в AVI (пошаговая инструкция)"