Если закачки не завершены, то никак (кроме, разве что, редактирования файла resume.dat чем-либо вроде BEncode Editor'а).
Для завершенных торрентов - достаточно просто стартовать их, uTorrent в этом случае проверит лишь наличие файлов, но не должен перепроверять их аутентичность.