Было у меня такое. Может программа установилась неправильно или во время кодирования шла нагрузка от других программ. Но если у Вас получилось сжать видео, пусть и без звука, это легко исправить с помощью
VirtualDubMod. Просто склеиваем видео со звуком: https://kinozal.me/forum/showthread.php?t=300